分子生物学

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  • 请问各位要预测已知基因和已知转录因子之间的结合位点,首先怎么寻找基因的启动子

    harden9159 发布于:2018.11.29

    关于查找基因的启动子,目前有两种不同的说法,一个是直接在NCBI里面查找,一个是根据基因的转录本分别查找其所对应的启动子,请问那种方法是正确的,还有找到启动子后,和转录因子在Jaspar数据库中进行结合位点预测,请问对于结果如何进行选择,一般是选择正义链的结果吗,然后根据评分进行取舍吗,谢谢

     
    1条评论 41浏览 邀请回答

    真·科研狗 回答于:2018年12月01日 10:29:251楼

     北京大学 医学部基础医学院 细胞生物学 博士 

    两种方法都可以,这个查找只是初步的预测而已,真正的启动子区域还需要通过实验验证。通过荧光素酶实验验证。第二个问题是选择正义链,对评分进行取舍,这些预测转录因子的方法是某种蛋白质能够结合一段序列,比如TATAA序列,如果你的启动子序列区域存在这个序列,就预示着可能该转录因子能够与启动子区域结合,这只是可能,最终需要通过实验验证


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