R科研作图学习小组

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  • R2-20 第二阶段第四次作业

    科研狗聪 发布于:2018.05.05
    library("httr")
    
    yearData=c()
    countData=c()
    url = "https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esearch.fcgi"
    
    for(i in 1:10){
      year=2007+i
      term = paste('(Small nucleolar RNA[TI]) AND ',year,'[DP]',sep = "")
      r <- POST(url, 
                body = list(
                  db='pubmed',
                  term=term,
                  retmode='json',
                  retstart=0,
                  retmax=10,
                  rettype='uilist'
                )
      )
      
      stop_for_status(r) #清除http状态字符串
      data=content(r, "parsed", "application/json")  
      esearchresult=data$esearchresult
      count = esearchresult$count
      yearData=c(yearData,year)
      countData=c(countData,count)
    }
    data=data.frame(year=yearData,count=countData)
    print(data)
    
    library(ggplot2)
    ggplot(data,aes(x=factor(year),y=count))+
      geom_bar(aes(fill=year), stat="identity",width = 0.8)+
      geom_text(label=data$count,vjust=-0.5)+
      xlab("year")+ylab("count")+ 
      theme_bw()+
      theme(legend.position="none")+
      ggtitle("R2-20")

    好奇怪,没办法上传图片或者附件

     
    0条评论 33浏览 邀请回答
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