R科研作图学习小组

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  • R2-03 第二阶段第四次作业

    微思微丝 发布于:2018.04.15

        R语言之统计某个研究领域的研究趋势

    library("httr")
    yearData=c()
    countData=c()
    url = "https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esearch.fcgi"
    
    for(i in 1:10){
      year=2007+i
      term = paste('(gold nanorods[MESH]) AND ',year,'[DP]',sep = "")
      r <- POST(url, 
                body = list(
                  db='pubmed',
                  term=term,
                  retmode='json',
                  retstart=0,
                  retmax=10,
                  rettype='uilist'
                )
      )  
      stop_for_status(r) #清除http状态字符串
      data=content(r, "parsed", "application/json") 
      #data里面存储了所有数据
      esearchresult=data$esearchresult
      count = esearchresult$count
      yearData=c(yearData,year)
      countData=c(countData,count)
    }
    data=data.frame(year=yearData,count=countData)
    print(data)
     
    library(ggplot2)
     ggplot(data,aes(x=factor(year),y=count))+
     geom_bar(aes(fill=count),stat='identity',width = 0.8)+
     geom_text(label=data$count,colur='red',vjust=-0.5)+##给每个柱子添加文字标签
     theme(axis.ticks = element_blank(),##隐藏刻度但是显示标签
           panel.grid.minor.y=element_blank(),
        panel.grid.major.y = element_blank(),
        axis.text.y =element_blank())+##隐藏横向的参考线和纵轴数值标签
     labs(x='year',y='count')

    20180415-2.png

    library(ggplot2)
     ggplot(data,aes(x=reorder(year,count),y=count))+
     geom_bar(aes(fill=year),stat='identity',width = 0.8)+
     geom_text(label=data$count,colur='red',vjust=-0.5)+##给每个柱子添加文字标签
     theme(axis.ticks = element_blank(),##隐藏刻度但是显示标签
           panel.grid.minor.y=element_blank(),
           panel.grid.major.y = element_blank(),
           axis.text.y =element_blank())+##隐藏横向的参考线和纵轴数值标签
     labs(x='year',y='count')

    20180415-1.png

     

     

     
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